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朱金伟/张荣光/张明杰合作揭示酶复合物自发相分离形成模块化无膜细胞器调控多种细胞功能

日期:2020-08-12  浏览次数:2792

王者荣耀竞猜平台 来源:BioArt


信号蛋白复合物(包括酶)在特定的亚细胞区域聚集是细胞信号转导的关键过程。在这一过程中,信号蛋白通过传统热力学原理介导的蛋白-蛋白相互作用被招募到特定的细胞区室高效调节信号转导。近年来研究发现,生物大分子能够通过液-液相分离(liquid-liquid phase separation, LLPS)机制聚集相关信号蛋白,形成无膜区室(membraneless compartment),LLPS提供了一种高效富集信号蛋白如酶复合物的全新方式,使生化反应在特定细胞区室独立、高效、有序的进行【1-3】

一般认为,LLPS的发生主要由以下两种机制介导:1.蛋白固有无序区域(intrinsic disorder region)或低复杂度区域(low complexity region)间的多价弱相互作用;2. 支架蛋白(scaffold protein)间通过多价的特异相互作用网络,形成相分离【4】。由于它们量少、活性高、反应特异,酶或酶复合物一般被认为是作为“乘客”进入无膜细胞器。

2020年8月10日,上海交通大学Bio-X研究院朱金伟团队、中科院上海生物化学与细胞生物学研究所张荣光团队和香港科技大学张明杰团队合作在Molecular Cell杂志发表了题为GIT/PIX Condensates Are Modular and Ideal for Distinct Compartmentalized Cell Signaling的研究论文。该研究发现GIT/PIX这对酶复合物通过多价特异相互作用,自发的形成相分离;GIT/PIX复合物无膜细胞器作为一个通用模块(module)通过与不同接头蛋白(adaptor)的相互作用被定位到细胞的不同区域发挥功能。

GIT是Arf GTPase的GTP酶活化蛋白(GAP),其ArfGAP结构域能够使Arf GTPase失活;PIX是Rho GTPase的鸟苷酸交换因子(GEF),其经典的DH-PH催化结构域能够激活Rho GTPase。有趣的是,GIT、PIX在体内常常以复合物形式存在。这对GAP/GEF复合物在很多细胞过程发挥功能,比如神经突触信号转导,细胞迁移,免疫反应等,其功能缺失也与一系列疾病的发生紧密相关【5】。但是,这对酶复合物的组装机制仍不明确。作者首先利用生化方法研究了GIT/PIX间的相互作用,发现GIT的GAP-ANK-SHD串联结构域(GAS)能够特异识别PIX的一段多肽片段(GIT-binding domain,GBD),其结合解离常数KD约为15nM。随后,作者解析了GIT/PIX复合物的三维结构(图1)



图1. GIT/PIX相互作用及其复合物结构


在了解GIT/PIX相互作用的分子机制后,作者意外的发现,在Hela细胞中表达GIT1-GFP,GIT1-GFP会形成明亮的liquid droplets(液滴),这些液滴会相互融合,并在荧光漂白后迅速恢复;纯化的GIT1蛋白在体外也能形成类似的液滴结构。这些物理特性都提示GIT1能够在体内外形成液-液相分离。作者进一步发现,结合PIX能够大大增强GIT1形成相分离的能力。有趣的是,GIT/PIX无膜细胞器能够通过GIT/Paxillin相互作用定位到黏着斑(focal adhesion)调控细胞迁移;通过PIX/Shank相互作用定位到神经突触后致密区(postsynaptic density)调控神经突触发育(图2),作者进而设计了一系列巧妙的实验去验证GIT/PIX无膜细胞器在不同细胞区域是通过相变而不是经典的蛋白-蛋白相互作用来行使功能。



                                                                       图2. GIT/PIX相分离调控不同信号通路
 
总的来说,这项研究发现酶或酶复合物可以通过多价、特异、高亲和力的相互作用自发形成液-液相分离;酶复合物形成的无膜细胞器能够作为通用的模块组件被上游不同的接头蛋白招募到特定的区域/信号通路发挥生物学功能(图3)




图3. GIT/PIX模块化无膜细胞器调控多种细胞信号转导通路


原文链接:
http://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.07.004


参考文献:

1. Banani, S.F., Lee, H.O., Hyman, A.A., and Rosen, M.K. (2017). Biomolecular condensates: organizers of cellular biochemistry. Nat Rev Mol Cell Biol. 18, 285–298.

2. Chen, X., Wu, X., Wu, H., and Zhang, M. (2020). Phase separation at the synapse. Nat. Neurosci. 23, 301–310.
3. Wu, X., Cai, Q., Feng, Z., and Zhang, M. (2020). Liquid-Liquid Phase Separation in Neuronal Development and Synaptic Signaling. Dev Cell. S1534-5807(20)30462-7.
4. Feng, Z., Chen, X., Wu, X., and Zhang, M. (2019). Formation of biological condensates via phase separation: Characteristics, analytical methods, and physiological implications. J. Biol. Chem. 294, 14823–14835.
5. Zhou, W., Li, X., and Premont, R.T. (2016). Expanding functions of GIT Arf GTPase-activating proteins, PIX Rho guanine nucleotide exchange factors and GIT-PIX complexes. J Cell Sci. 129, 1963–1974.



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